初夏時，日本大多地區都會有雨季，日文叫做Tsuyu（或Baiyu），亦即所謂的「梅雨」，因為雨季剛好和梅子成熟的季節同時。雨季是由於北方的冷氣團和南方的暖氣團滯留徘徊，造成氣候不佳的鋒面徘徊在日本群島數週之久。

日本多數地區的雨季都會從6月初下到7月中，而在沖繩可能提早1個月來臨。日本北部的北海道幾乎不會受到雨季影響。下列表格為日本氣象局所提供的日本各地區平均雨季開始和結束日期：

地區	開始日	結束日
沖繩	5月8日	6月23日
九州南部	5月29日	7月13日
四國	6月4日	7月17日
近畿（包括大阪、京都）	6月6日	7月19日
關東（包括東京）	6月8日	7月20日
東北北部	6月12日	7月27日

雨季期間並非每天都會下雨。事實上，東京在6月平均只有12天下雨，且日照時數達120小時。雨量則每天不一定，有時傾盆大雨，有時則只是偶爾有毛毛雨。

雖然如此，雨季仍然不是造訪日本最合適的季節，儘管仍然有好處。舉例而言，6月旅遊活動比較少，因此許多熱門的戶外景點遊客也會比平常少。

另外，有些景點在雨季可能特別有吸引力，特別是一些寺廟、 庭園、溫泉還有會在雨季盛開的繡球花。想要享受雨季旅遊，必須要有正確的態度和防雨措施。以下列舉一些雨季特別有特色的景點：

雨季結束後，日本就會逐漸轉熱，也會進入較為炎熱的夏天氣候，旅遊前也可參考什麼時候去日本旅遊，再觀看即時氣象預報。