日本由四個主要的島組成,本州、北海道、九州及四國皆為四通八達且可靠的鐵路網所包覆。對外國遊客而言,火車是探索日本非常方便的方式,不過這也得歸功於日本鐵道通票的推出。
日本鐵路網絡,特別是在都會區內或都會區附近,大約百分之七十都是由日本鐵路(JR)所有並經營;剩下的百分之三十才分屬眾多私鐵公司。
更多詳細資訊可參考日本火車票、時刻表及如何搭乘火車。
日本鐵路(JR)
日本鐵道株式會社(JR集團)的前身為JNR(日本國鐵),JNR因為龐大赤字問題,於1987進行私有化。
JR集團由六家區域性旅客鐵道公司(JR北海道、JR東日本、JR中日本、JR西日本、JR四國及JR九州)及一家全國性的貨物鐵道公司(JR貨物)所組成。七家公司串連起全國的城市、區域及區間火車路線,寢台夜車及子彈列車(新幹線)。

私有鐵道公司
在日本有一百多家私有鐵道公司。規模較小者僅有一條營運路線,較大者所經營的鐵路網則相當廣。以下為幾家主要的私鐵公司:
關東地區
東武鐵道
東武鐵道經營許多往郊區及東京以北各縣的鐵路線(約460公里)。
吸引遊客的特色是:這條路線可以到日光、川越。
小田急電鐵
小田急經營三條從東京往西東京及神奈川縣的路線(約120公里)。
吸引遊客的特色:這條路線可以到箱根。
東急電鐵
東急的鐵路網在東京以南,有兩條主要幹線,加上數條較短路線(約100公里)。
吸引遊客的特色:這條路線可以到橫濱。
京成電鐵
京成經營從東京到千葉縣的路線,包含一條主要幹線及數條支線(約100公里)。
吸引遊客的特色:這條路線可以到成田機場。
西武鐵道
西武經營中東京以西的郊區鐵路網(約180公里)。
吸引遊客的特色:這條路線可以到秩父。
京急電鐵
京急連接東京與橫濱及神奈川縣南部(約90公里)。
吸引遊客的特色:這條路線可以到羽田機場。
京王電鐵
京王經營東京以西的鐵路網(約80公里)。
吸引遊客的特色:這條路線可以到高尾山。
中部地區
名古屋鐵道
名鐵經營的鐵路網很廣,繞著名古屋周圍(約500公里)。
吸引遊客的特色:這條路線可以去犬山及中部國際機場。
近畿地區
近畿日本鐵道
這是最大的私鐵公司。近鐵經營的鐵路網很廣,範圍在南近畿區,服務縣市包括大阪、京都、奈良、伊勢及名古屋(約570公里)。
南海電鐵
南海經營的鐵路網位於南大阪及和歌山縣(約170公里)。
吸引遊客的特色:這條路線可以去關西機場及高野山。
阪急電鐵
阪急在北大阪經營數條路線,可連結大阪與神戶及京都(約150公里)。
京阪電車
京阪經營一條主要幹線及數條短線,連接大阪與京都(約90公里)。
阪神電車
阪神經營一條往返大阪與神戶的主要幹線,及一些短程支線(約50公里)。
九州
西日本鐵道
西鐵經營福岡線的鐵路網,環繞福岡市(約120公里)。
吸引遊客的特色:這條路線可以到太宰府。
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